Hola,
Si al crear la cuenta pusiste por error el DNI y en realidad tienes NIE, lo más recomendable es contactar directamente con el banco o la entidad donde hiciste el registro.
Cada entidad tiene su propio sistema de verificación y, normalmente, pueden corregirlo si les envías una foto de tu NIE o si haces la actualización desde la app, el correo o el canal que te indiquen.
Si la plataforma no te deja continuar online, lo más rápido suele ser acudir a una oficina o escribir al servicio de atención al cliente para que actualicen el documento manualmente.
Puedes ver más información sobre la documentación que suelen aceptar los bancos aquí: